化学的および生物学的表現

化学的表現

アクセルリスのケムインフォマティクス スイート —  Accelrys Draw、Accelrys Direct、 Accelrys Cheshire — は、四面体表現、非四面体表現、および立体表現をサポートしており、化学構造に組み込む対象には特定の制限値を設けていません。研究者は、2D構造や3D 構造、マーカッシュ 構造の登録と検索が可能です。

ポリマー、混合物、配合剤の表現は、ポリマー業界の主流となっています。アクセルリスでは、マーカッシュ 構造を表現する最新技術を提供しています。特許書類には欠かせないものであり、一般消費財や化学業界でもよく使用されます。

アクセルリスが提供する反応式の登録と検索に関する高度な技術は、さまざまな商用および自社開発の データベースと化学電子実験ノートをサポートしています。この技術は、現在使用できる最も堅牢で信頼性の高い反応ベースのエニュメレーションの基盤となっています。また、保護、反応、脱保護が必要となる多段階反応のほか、実際の複雑な反応 （ウギ 反応など） を処理できることが実証されています。

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生物学的表現— バイオインフォマティクスとケムインフォマティクスの架け橋

生物学的配列は簡単な配列を簡潔に表現する方法ですが、化学修飾された配列を表現する能力には限界があります。UniProt ファイル形式では、特性のセクションで配列と修飾を別々に記録しますが、配列と特性を組み合わせることが必要となるため、結果があいまいなものになる可能性があります。これに対し、molfile のようなケムインフォマティクス形式では、配列と化学修飾をコネクションテーブルに正確に記録します。このテーブルを使用して配列とその特性を比較しやすくしますが、ファイルのサイズが非常に大きなものとなるため、管理が困難です。

アクセルリスが開発した新しい Self-Contained Sequence Representation（SCSR）では、バイオインフォマティクス記法とケムインフォマティクス記法の特性の優れた部分を組み合わせたハイブリッド形式で配列をエンコードし、バイオインフォマティクス形式固有の解釈の難しさと純粋なケムインフォマティクス形式の冗長性を解決します。

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