Pipeline Pilot Mass Spectrometry for Proteomics Component Collection

Mass Spectrometry for Proteomics Collection は、プロテオミクスやメタボロミクスの ワークフローをカスタマイズして自動化するためのコンポーネントのパッケージです。プロトコルは、実験データを各種コンポーネントに流して、結果の読み取り、書き込み、視覚化、処理、分析、比較、および公開します。データ モデルは、大容量ファイルの迅速な処理をサポートし、詳細情報を複数レベルで保持します。Pipeline Pilot のグラフィカルなプロトコル構築機能を利用して、ペプチド・タンパク質同定やディファレンシャル・プロファイリングなどの複数の分析手順を簡単に構築できます。コードを開発する必要はありません。

Sequence Analysis Collection と Gene Expression Colletion の機能を組み合わせ、質量分析データを他の実験と簡単に比較して、バイオマーカーを探索できます。

Mass Spectrometry Collection によって、次のことを実現できます。

• RAW*、*.wiff、SEQUEST DTA、ANDI (netCDF)、Mascot MGF、mzXML ファイルの読み取り
• インタラクティブ・クロマトグラム、2D 質量分析ランチャート、スキャン チャート、フィーチャー ピーク チャート、リテンションタイムのドリフトを示す チャート、フラグメントグラム、ドリルダウン機能付きペプチド／タンパク質ビューア、ヒートマップでデータを表示
• X!Tandem を使用したタンパク質同定、ペプチドがマップされたタンパク質の抽出
• XCMS を使用したディファレンシャル・プロファイリングのためのユニークなピークの抽出、識別、アラインメント
• 高度なレポート作成機能による、Web Port でのインタラクティブな結果の公開
• タンパク質量の ASAPRatio を 2 つのタグ付きサンプルから算出

Mass Spectrometry for Proteomics Component Collection のデータシート