トランスレーショナル リサーチ

トランスレーショナル リサーチは、従来の創薬パラダイムを変革しました。ターゲット識別、ターゲット検証、リード化合物の最適化というこれまで一続きに行われてきたプロセスを、患者の病状や治療効果を十分に把握しながら、並行して実行できるようになりました。 さらに、次世代シーケンシング、遺伝子発現、プロテオミクスにおける技術改革により、多数の患者サンプルを解析できるようになりました。

この創薬のパラダイムシフトは、開発ライフサイクルの短縮と臨床成功率の向上というメリットをもたらしましたが、研究者が従来の部署の壁を越えて臨床試験データや実験データにアクセス、統合、分析しなければならないという新たな問題点も生み出しました。

アクセルリスのサイエンティフィック インフォマティクス プラットフォーム Pipeline Pilot は、組織が抱えるこのような問題を克服します。 Pipeline Pilot は、以下の機能を持つ高度なデータ マイニング/分析ツールを 1 つのプラットフォームに統合しています。

• ビジネスルールの作成
• サードパーティのアルゴリズムとアプリケーションの統合
• ドラッグアンドドロップによるワークフローの構築と共有
• インタラクティブなレポート作成

臨床データや分子データへのアクセスと統合は、BioFortis™ LabMatrix システムとのシームレスな統合によって簡略化されています。この HL7 準拠のフレームワークは、臨床データや分子データの迅速な検索に役立ちます。 Pipeline Pilot を使用すると、組織全体の研究者がトランスレーショナル リサーチを適切に管理して共有できます。

さらに、生物学用 Symyx Notebook by Accelrys という電子実験ノートも提供しています。企業全体で1つのノートを使用して in vivo/ in vitro における実験を計画、実行、記録することで、運用効率の向上と低コスト化に役立ちます。

製品情報

Pipeline Pilot データ検索、フィルタリング、分析、レポート作成のコンポーネントをグラフィカルに組み合わせて、トランスレーショナル リサーチのワークフローを作成および自動化します。

Pipeline Pilot コンポーネント コレクション:

Biology Collection: Mass Spectrometry for Proteomics、Gene Expression、Sequence Analysis、Next Generation Sequencing と複数のコンポーネント コレクションが提供されています。これらから提供される必要十分なアルゴリズムとベスト プラクティス プロトコルを使用して、ゲノミクス データの管理、分析、レポート作成のワークフローを作成および自動化します。

Imaging Collection: Imaging Collection および Advanced Imaging Collection を使用して、画像データをほかのデータと統合し、画像データの処理、分析、計測、統合、カタログ化、検索、レポート作成を行うためのプロトコルを開発します。

Analysis and Statistics Collections:R Statistical Analysis Tools を実装して強力な統計分析を実行します。 Modeling Component CollectionとAdvanced Modleing Component Collection を使用して、クラスタリング、ベイズ学習、RP ツリー学習、類似性検索、パレート最適化を実行します。

Text Analytics Collection:Text Analytics Component Collection を使用して、PubMed、US patents、NIH grants、その他の書類を検索します。

生物学向け Symyx Notebook by Accelrys 柔軟なエンタープライズ ELN (Electronic Laboratory Notebook)を使用して、生物化学情報の記録やプロセスを合理化し、共同研究者や委託研究機関とのコラボレーション能力を向上させます。

参考資料

アクセルリスのトランスレーショナル リサーチ関連製品の詳細については、次の資料を参照してください。

• Multi-Analyte Profiling of Marathon Runners (Physiological Genomics 誌掲載): 業界トップのバイオマーカー検査機関 Rules-Based Medicine は、Pipeline Pilot を使用して、マラソン選手から採取した血清サンプルに multi-analyte profiling を実行しました。
• サードパーティ PK/PD アプリケーションの統合に関する考察：Pipeline PilotにNONMEM などのツールを統合することで、薬物動態学/薬力学(PK/PD)データの統合、分析、レポート作成などの手間のかかる作業を軽減できることが説明されています。
• Using Pipeline Pilot to Analyze Biological Threat Poster: アクセルリスの研究者が急性肺障害のバイオマーカー研究に Pipeline Pilot を使用しました。
• Accelrys' Personalized Medicine Blog