創薬化学

創薬化学者は、新しい医薬品を設計、合成、開発するために、化合物に関して重要な決定を行う必要があります。このプロセスでは、企業内の関連するすべての化学データ、生物学データ、利用可能な文献に簡単かつ迅速にアクセスする必要があり、既存の化合物や候補化合物案に関する重要な情報を提供する計算的手法も必要です。そのため、ソフトウェア プログラムをあれこれと使用したり、目的の分子やその誘導体に関するデータ収集されるまで待つことも少なくありません。

アクセルリスの製品とソリューションは、創薬化学者の効率を向上することに役立ちます。さまざまなリポジトリからデータを取得してレポートを作成したり、パラレル ライブラリやコンビナトリアル ライブラリを発生および分析したり、化合物ライブラリを分析してファミリーを識別することができます。

製品情報

discovery studioインタラクティブ なモデリング環境を提供します。3D で分子のスケッチとアライメントを行い、コンフォメーション モデルを生成し、分子のエネルギー最小化とアライメントを行い、原子または共通フィーチャに基づいて構造を重ねます。

Pipeline Pilot データ検索、フィルタリング、分析、レポート作成の各コンポーネントをグラフィカルに組み合わせて、ワークフローを構築します。MedChem のサンプル アプリケーションについては、以下を参照してください。

創薬化学者のための Pipeline Pilot Collection:

Chemistry collection  化合物コレクションをプロファイル、フィルタ機能。化合物ライブラリの作成が可能です。

text analytics collection このコンポーネント セットを使用して、PubMed、米国特許、NIH Grants、個人論文をマイニングします。

ADMET collection 分子の吸収、分布、代謝、排泄、毒性 (ADMET) 特性の予測を計算します。

modeling collection 学習/データ モデリング機能、統計フィルタ、および現実的な大規模データ セット向けに最適化されたクラスタリング コンポーネントからなるこの機能セットを活用します。

advanced modeling collection データ マイニングを迅速に実行し、ツリーを可視化し、Recursive Partitioning コンポーネントとPareto Optimization コンポーネントを使用して値のトレードオフが最良のサンプルを特定します。

サンプル アプリケーション

MedChem のサンプル アプリケーション簡単で使いやすい Web インタフェース内で、化合物の一覧を管理し、それらの化合物に関する情報を収集し、定型処理タスクを実行します。このサンプル アプリケーションは、アクセルリスのサイエンティフィック インフォマティクス プラットフォーム Pipeline Pilot 上に構築されています。

アクセルリス サンプル アプリケーションの詳細

参考資料

創薬化学のためのアクセルリス製品の詳細については、次の資料を参照してください。

• MedChem のサンプル アプリケーションの概要
• Web セミナー: MedChem のサンプル アプリケーション
• 応用事例: Pipeline Pilot による PubMed 傾向分析
• 創薬化学者の応用事例